De son PC aux offres des serveurs nationaux
Il existe 4 niveaux de ressources de calcul :
- Son PC
Ordre de grandeur : 50 G Flops
- Les serveurs de calcul d’un laboratoire
Ordre de grandeur : 5 T Flops
En savoir plus notre serveur de calcul
- Les mésocentres
Ordre de grandeur : 50 T Flops
Le mésocentre de Franche-Comté offre une puissance de 11 T Flops
- Les serveurs nationaux
Ordre de grandeur : 1 P Flops
Le serveur de calcul disponible au LMB
1. Vue d’ensemble du matériel
Machine bi-processeur octo-coeur (64 bits - Little Endian) :
- Marque Dell Poweredge R630
- Processeur Intel Xeon E5-2667 v3 (x2)
- 8 coeurs
- 16 threads
- Fréquence : 3.2 GHz (base) -> 3.6 GHz (max)
- Cache L3 : 20MB
- Cache L2 : 256K
- Cache L1i/d : 32K
- Mémoire RAM 64 Go
- Disque dur 500 Go
- Localisation dans la salle de serveurs (climatisée)
2. Vue d’ensemble des logiciels installés
La plupart des compilateurs sont disponibles sans manipulation particulière.
Les logiciels de calculs sont régulièrement maintenus à jour. Quelques rares cas sont accessibles sans manipulation particulière, la plupart nécessite l’utilisation des commandes module pour les activer. La commande module avail permet d’accéder à la liste des logiciels et des versions disponibles.
2.1 Système d’exploitation
- Une distribution Debian stable 8 "Jessie"
2.2 Compilateurs/debbugers disponibles
- GCC (Gnu Compiler Collection) version 4.9.2 incluant :
- gcc (Compilateur GNU pour C)
- g++ (Compileur GNU pour C++)
- gfortran (Compilateur GNU pour Fortran)
- GCC (Gnu Compiler Collection) version 6.3 incluant (via module) :
- gcc (Compilateur GNU pour C)
- g++ (Compileur GNU pour C++)
- gfortran (Compilateur GNU pour Fortran)
- gp2c (Compileur GP vers C) en version 0.0.9pl5 (via module)
- gp2c (Compileur GP vers C) en version 0.10 (via module)
- OpenMPI version 4.9.2 incluant :
- mpicc (Wrapper pour C)
- mpic++ (Wrapper pour C++)
- mpif77 (Wrapper pour Fortran 77)
- mpif90 (Wrapper pour Fortran 90)
- Python version 2.7.9
- Python version 3.4.2
- Qt version 4.8.6
- gdb (debbugueur GNU de la GCC) version 7.7.1
- pdb (debbugueur python) version 2.7.9 et 3.4.2
- ipdb (debbugueur python basé sur Ipython) version 0.8
- GNU Make version 4.0
- CMake version 3.0.2
- PKG-config version 0.28
2.3 Logiciels et librairies
- Librairies BLAS version 1.2.20110419 (de base)
- Boost C++ libraries version 1.55 (de base)
- FEniCS (consulter J.Y. Rolland)
- FreeFem++ version 3.44 (via module)
- FreeFem++ version 3.51-3 (via module)
- Librairies LAPACK version 3.5.0 (de base)
- Maple version 15 et 2015 (via module)
- Matlab version 2012a et 2015a (via module)
- Librairies MPI compilées sur la GCC 4.9.2
- Librairies MUMPS version 4.10.0 (de base)
- Pari/GP version 2.7.5/stable 2.9.1/stable et 2.8.0/dev (via module)
- Sage version 6.10 (via module)
- Scilab version 5.5.2 (via module)
- R est installé en version 3.2.3 (de base) 2.15.3 (via module)
2.4 Utilitaires
- screen : Multiplexeur de terminaux interactifs permettant de gérer ses terminaux physiques par session depuis différents points de connexion
- tmux : Alternative (un peu) plus conviviale à screen
3. Accès au serveur et aux applications depuis un poste client
La documentation se trouve sur notre intranet (rubriques "Fiches pratiques" puis "Accès à gauss").